El territorio del municipio estuvo ocupado en tiempos prehispánicos
por los indios ópatas. El pueblo de Huépac fue fundado en
el año de 1644 por el misionero jesuita Gerónimo de la Canal
con el nombre de San Lorenzo de Güepaca, que para efectos administrativos
pertenecía al rectorado de San Francisco Javier. El nombre dado
a este municipio, obedeciendo a su ubicación geográfica significa
Güepaca, valle grande; de Güe grande y paca, valle en lengua
ópata.
Con categoría de pueblo de visita a la misión de Banámichi.
Después de la independencia en 1810, estuvo administrado por
el juez de paz, obtuvo la categoría de municipio en 1930 y estaba
adscrito al municipio de Ures; en 1930 fue incorporado al municipio de
Arizpe y en mayo de 1931 consiguió su autonomía.
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