La historia nos habla que fueron los Chichimecas quienes vinieron en busca de tierras, llamando a dicho Pueblo Totolapan.
Los pobladores de Totolapan fueron dominados por los Xochimilcas y posteriormente por Moctezuma, a quien tributaban y servían en las guerras para las cuáles proveían de armas.
Durante la conquista mientras se preparaba el sitio de Tenochtitlan, Cortes envío a Gonzalo de Sandoval a Oaxtepec y en su paso tomo Totolapan.
Después de la conquista, las tierras de encomienda fueron concedidas al señor Diego Olguín, pero al crearse el marquesado del valle de Oaxaca, fueron anexadas a este.
Los agustinos se establecieron ahí en 1536, la iglesia del convento fue dedicada a San Guillermo y se terminó en 1545.
El convento de Totolapan es uno de los mas antiguos que existen en México.
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