Sobre la fundación del pueblo de Sotuta 'Agua que da vueltas' no se tienen datos exactos. Durante la época prehispánica perteneció al cacicazgo de Sotuta gobernado por los Cocomes. Después de la Conquista estuvo bajo el régimen de las encomiendas, entre las que se pueden mencionar la de Don Gonzalo Méndez y Juan Magaña en 1549; Don Gonzalo Magaña y Diego de Magaña en 1607, y la de Don Francisco de Magaña y Alfonso Hernández en 1652. El desarrollo de la población, empieza en 1821 cuando Yucatán se independiza de la Corona Española, y llega a ser cabecera del partido de Beneficios Bajos en 1825.
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