La comunidad original, ubicada en el sitio que ahora ocupa la ciudad de Cortazar, fue una aldea otomí denominada Degnio Amole y también Jali-hui. Esta aldea pasó después a formar parte del dominio de los mexicas, quienes le llamaron Amolii, voz náhuatl que significa "Raíz que se talla y produce espuma".
En la época de la Colonia, el 5 de mayo de 1721, se hizo su fundación legal con el nombre de San José de los Amoles, el cual conservó hasta el 21 de octubre de 1857, fecha en que decretó el Congreso Constituyente del Estado que se llamase Villa de Cortazar
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