Orígenes
El nombre de este municipio, deriva de que cerca de la cabecera del mismo se encuentran, o al menos se encontraban en el siglo XVII, numerosas lagunas chicas.
En algunas partes de este municipio se encuentran vestigios arqueológicos de interés y esto es principalmente en dos localidades: una al sur de la Villa de Lagunillas, que es el pueblo de San Rafael, este es el más importante. El otro núcleo, también interesante, se encuentra en Pinihuan, ésta localidad se encuentra al norte del municipio de Lagunillas ya inmediata a la línea divisoria con el vecino municipio de Rayón.
Lagunillas fue uno de los lugares que desde mediados del siglo XVI visitaron con propósitos de evangelización los franciscanos fray Juan de San Miguel y fray Bernardo Coussin. En 1607 otro fraile franciscano, fray Juan de Cárdenas, ciertamente pasó por ese territorio, iba a Pinihuan y a Gamotes, donde levantó '€œcapillas de paja'€Â. En Lagunillas hizo construir una de ellas, esta es la más primitiva huella de la cristianización en esta región antes de la fundación de la '€œMisión de San Antonio de Padua de las Lagunillas'€Â, que fue hecha el 6 de julio de 1617 por el padre franciscano Juan Bautista de Mollinedo. Por entonces predicador y guardián del convento de Xicho.
De tal fundación se levantó acta. Asimismo, existe el acta de fundación de la '€œMisión de Nuestra Señora de la Presentación de Pinihuan'€Â, que se verificó dos días después.
En el acta de '€œconversión de Lagunillas'€ se expresó que habían concurrido algunos capitanes de las rancherías inmediatas y se dijo que todas ellas eran de indios pames. Se dispuso la misa en una enramada de '€œjacal'€ y terminada la misa fray Juan de Bautista Mollinedo cogió la cruz y levantándola en alto, declaró que por licencia y comisión de su majestad, tomaban posesión jurídica y posesión y amparo de jurisdicción eclesiástica de esta conversión, y la declaraba parroquia, cuyos términos señaló. Firmaron este '€œauto de posesión'€ el Alcalde Mayor de las Minas Xichú, don Juan de Porras y Ulloa y otros personajes.
Como se dijo, esta fundación había sido hecha en territorio poblado por indígenas de nación pame. De esto hay mucho que hablar, como que la pamería todavía subsiste en la región. Existiendo en la actualidad aproximadamente 3,500 indígenas pames, todos ellos reconocen como su Capitán un pueblo que se llama Santa María Acapulco, que se encuentra ubicado en el vecino de Santa Catarina.
Algunos historiadores sostienen que los pames no difieren mucho de los guachichiles y que con ellos están emparentados. El pame con sus dialectos, lo mismo que el jonaz o meco que mucho se le parece, es de familia otomí y tiene grandes analogías con el chino.
Desde la fundación de Lagunillas hasta la primera mitad del siglo XVIII, la historia de ese pueblo, es la historia de incontables e interminables agresiones e invasiones sufridas por los indígenas, a los cuales se les proporcionaron suficientes tierras, que siempre fueron codiciadas por los españoles que entraron a la región como colonos.
Los litigios fueron larguísimos y la inmensa mayoría no se resolvió nunca.
En todas épocas no les faltaron a los indígenas, buenos y capaces defensores de su causa, siempre quejándose sobre los despojos sufridos. Ellos fueron entre otros, el capitán Bartolomé Pérez de la Cruz, Protector de la Custodia de Ríoverde. También tenemos al Padre fray Francisco Ayeta, desde Madrid y en su carácter de procurador de todas las indias, presentó al Rey, promoviendo por los franciscanos un memorial voluminoso, que consta de 7 páginas sobre los despojos de tierras a los indígenas. Desde 1692 hasta 1694 fungió como Alcalde mayor de San Luis, don Domingo Terán de los Ríos y éste, en sus memorias relata haber conocido a fray Martín de Herrán, digno sucesor de los Mollinedos y Cárdenas, fundadores de esa custodia. Durante 20 años consecutivos fray Martín de Herrán defendió valerosamente a mas de 10,000 chichimecas pobladores, desde Lagunillas a Tula y desde Santa Catarina hasta El Mar.
Todo fue inútil, nada se logró y los indios pames despojados tuvieron que remontarse a la sierra, y los que quedaron todavía viviendo en las inaccesibles localidades que no ambicionaron los colonos españoles, están todavía en los sitios donde hoy se encuentran los centros de la pamería: La Palma, Gamotes, Guayabos, Santa María Acapulco, Tanlacud, etcétera, así fue como la nación pame quedó dividida en pequeñas cantidades tribales apegadas a centros de mestizos y lejos de todo contacto heterogéneo, por lo que han perdido toda originalidad y vida propia.
Independencia
Durante la época de la guerra, nada sucedió en Lagunillas. En 1826 se dictó la primera Constitución del Estado, y en abril de 1830 la Legislatura del Estado decretó la '€œLey Sobre Arreglo de Municipios'€Â. En el artículo 16 de la mencionada ley, se refiere a la Villa de Lagunillas como cabecera del municipio del mismo nombre. Allí se señalaron los límites de su jurisdicción comprendiéndose en ella el bajío donde está situado el pueblo de Pinihuan, que a la fecha es todavía una de las localidades más importantes.
En septiembre de 1833 estuvo en Lagunillas, de paso y sólo para imponer préstamos forzosos, el general Esteban Moctezuma, dizque para auxiliar a la 2a. División del Ejército Libertador, este abuso ya lo había cometido en Rioverde, Ciudad Fernández, Gamotes y Pastora.
A los vecinos de Lagunillas les requisó poco, pero después el gobierno del estado reconoció como deuda del Estado esas cantidades, obligándose a pagarlas y al efecto dictó su decreto No. 50 del 7 de octubre de 1835, en el cual se mencionan los nombres de los vecinos de Lagunillas afectados.
En el año de 1900 quedó terminada la línea telefónica entre Rayón y Lagunillas. El Gobernador del Estado, Ing. Blas Escontría y el Presidente Municipal de Lagunillas, cruzaron palabras de felicitación, según se publicó en el periódico oficial del 29 de diciembre de 1900.
Aerolito
En diciembre, a principios de enero de 1909, la localidad de Lagunillas se conmovió con la caída de un aerolito. Se dio el aviso correspondiente al Instituto Geológico Nacional y esta institución ofreció mandar a un comisionado. Se concluyó que el aerolito había caído a las dos y media de la tarde y que no obstante la clara luz del sol que había a esa hora, se pudo apreciar que la masa del meteoro era muy grande, por lo que se le conceptúo como entre los 3 de mayor tamaño que entonces existían en México.
Revolución
Vino la Revolución y pronto la guerra civil se extendió por todo el país, el 29 de abril de 1911, los hermanos Terrazas obtuvieron su primer triunfo en la huasteca potosina con la toma de Lagunillas. Y al día siguiente unidos a los hombres de Isauro Verástegui y luego a los de Miguel Acosta, entraron a San Ciro, liberaron a los presos y se hicieron de fondos y víveres de la gente pudiente, del clero y del comercio
Cráter
En una loma, a 3 kilómetros de la cabecera de Lagunillas, se llega al aparato volcánico que es el más grande de San Luis Potosí, con un enorme cráter o mejor dicho, conjunto de cráteres de explosión, pudiendo contarse hasta 7, todos formando un racimo en la misma oquedad. Este hoyanco está rodeado por altos cerros. Es allí donde dicen los vecinos del lugar que se oyen ruidos subterráneos muy fuertes y tiembla la tierra, provocando derrumbes. Se comenta también que del fondo del cráter salen fuertes '€œneblinazos'€Â. Ese conjunto de cráteres se llama '€œLas culebras'€Â.
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